MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 plasmid pCBF

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017298	CTT	2	6	17	22	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017298	TATTT	2	10	38	47	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017298	TA	3	6	243	248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017298	AGG	2	6	254	259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017298	AAT	2	6	470	475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017298	ATTT	2	8	486	493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017298	TAAA	2	8	507	514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017298	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017298	TAAC	2	8	929	936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017298	T	6	6	942	947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017298	TAA	2	6	957	962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017298	ATG	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017298	A	7	7	1040	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017298	GTA	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017298	T	6	6	1066	1071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017298	CTAT	2	8	1076	1083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017298	TATC	2	8	1093	1100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017298	TATGA	2	10	1110	1119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017298	A	6	6	1358	1363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017298	ATA	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017298	TA	3	6	1413	1418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017298	AAT	2	6	1434	1439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017298	A	6	6	1456	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017298	TTATAA	2	12	1485	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017298	T	6	6	1503	1508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017298	A	7	7	1510	1516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017298	AGG	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017298	A	6	6	1714	1719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017298	A	6	6	1922	1927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017298	ATT	2	6	1930	1935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017298	T	7	7	1934	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017298	CCT	2	6	2585	2590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017298	ATT	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017298	TA	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017298	TA	5	10	2628	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017298	TAA	2	6	2645	2650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017298	TA	3	6	2651	2656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017298	ATTTTT	2	12	2824	2835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017298	TTA	2	6	2859	2864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017298	ATT	2	6	2869	2874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017298	ATA	2	6	2875	2880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017298	AGG	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017298	GGGT	2	8	3490	3497	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017298	AATT	2	8	3506	3513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017298	AAGG	2	8	3526	3533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017298	TTAC	2	8	3642	3649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017298	TC	3	6	3656	3661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017298	AT	3	6	3866	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017298	TTTA	2	8	3888	3895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017298	TAC	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017298	TAT	2	6	4192	4197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017298	TTA	2	6	4204	4209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017298	TAT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017298	TAT	2	6	4234	4239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017298	TAAA	2	8	4257	4264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017298	T	6	6	4305	4310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017298	ATTA	2	8	4322	4329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017298	TATT	2	8	4345	4352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017298	TAT	2	6	4355	4360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017298	TATT	2	8	4368	4375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017298	TAT	2	6	4378	4383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017298	ATT	2	6	4394	4399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017298	ACTT	2	8	4448	4455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017298	TTA	2	6	4465	4470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017298	TA	3	6	4469	4474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017298	TAC	2	6	4480	4485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017298	TAAT	2	8	4490	4497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017298	TGA	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017298	TA	3	6	5342	5347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017298	A	6	6	5355	5360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017298	TAAA	2	8	5414	5421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017298	ATAAA	2	10	5474	5483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017298	AT	3	6	5485	5490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017298	AATTA	2	10	5500	5509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017298	TA	3	6	5595	5600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017298	TTA	2	6	6620	6625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017298	CAC	2	6	6627	6632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017298	A	6	6	6677	6682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017298	TTG	2	6	6702	6707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017298	T	7	7	6764	6770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017298	ACT	3	9	6943	6951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017298	TAG	3	9	6958	6966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017298	T	7	7	6967	6973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017298	CTT	2	6	6982	6987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017298	A	8	8	7094	7101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017298	TAATA	2	10	7103	7112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017298	CCTTT	2	10	7131	7140	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017298	TAA	3	9	7172	7180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017298	ATA	3	9	7743	7751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017298	AGTT	2	8	7755	7762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017298	GGT	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017298	TAG	2	6	7799	7804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017298	ATA	2	6	7814	7819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017298	TA	3	6	7818	7823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017298	A	6	6	7847	7852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017298	AAAAT	2	10	7862	7871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017298	ATT	2	6	7937	7942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017298	T	7	7	7947	7953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017298	TAT	2	6	8441	8446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017298	TCC	2	6	9116	9121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017298	TAAT	2	8	9125	9132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017298	AAT	2	6	9134	9139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017298	AAAT	2	8	9161	9168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017298	AT	3	6	9177	9182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017298	AAT	2	6	9186	9191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017298	A	6	6	9199	9204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017298	GAT	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017298	ATTC	2	8	9278	9285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017298	A	7	7	9302	9308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017298	ATAA	2	8	9312	9319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017298	TAA	2	6	9352	9357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017298	T	8	8	9387	9394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017298	AT	4	8	9415	9422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017298	AAAATA	2	12	9428	9439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017298	AGG	2	6	9440	9445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017298	TA	3	6	9976	9981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017298	TTA	2	6	9982	9987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017298	ACC	2	6	10938	10943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017298	ATA	2	6	10970	10975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017298	A	6	6	10983	10988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017298	ATA	2	6	11009	11014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017298	TAA	2	6	11015	11020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017298	TA	3	6	11040	11045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017298	AATA	2	8	11046	11053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017298	T	7	7	11086	11092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017298	ATA	2	6	11124	11129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017298	TTC	2	6	12585	12590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017298	ATTAA	2	10	12615	12624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017298	T	7	7	12668	12674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017298	TTTTA	2	10	12677	12686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017298	TTA	2	6	12701	12706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017298	TAT	2	6	12756	12761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017298	T	6	6	12771	12776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017298	CTATTT	2	12	13592	13603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_017298	TA	3	6	17384	17389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017298	TAT	2	6	17422	17427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017298	ATA	3	9	17428	17436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017298	ATT	2	6	17479	17484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017298	T	8	8	17483	17490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017298	AT	3	6	17525	17530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.